Набор Thermo Scientific Bovine Genotypes Panel 3.1 предназначен для тестирования и идентификации происхождения крупного рогатого скота с использованием локусов ДНК с короткими тандемными повторами (STR).

Набор Bovine Genotypes Panel 3.1 позволяет проводить ко-амплификацию 18 микросателлитов в одной мультиплексной ПЦР-реакции. Один праймер из каждой пары праймеров помечается флуоресцентным красителем на конце. После ПЦР фрагменты разделяются и обнаруживаются в одной инъекции электрофореза с использованием автоматического электрофорезного прибора ( см. рисунок 2). Кроме того, в набор входит контрольная ДНК крупного рогатого скота для проверки приемлемых условий ПЦР и электрофореза. Реагенты и протоколы набора Bovine Genotypes Panel 3.1 оптимизированы для получения схожих размеров пиков (выходов амплификации) для каждого локуса. Аллельные вызовы, полученные с помощью этого набора, представляют собой истинные аллели особи, а не «пики плюс-А» или «разделенные пики», которые обычно интерпретируются при использовании, например, обычной ДНК-полимеразы Taq . В наборе используется ДНК-полимераза Phusion Hot Start, которая обладает корректирующей активностью и устраняет «пики плюс-А».

Thermo Scientific Bovine Genotypes Panel 3.1 охватывает все 12 локусов STR, рекомендованных Международным обществом генетики животных (ISAG) для рутинного использования при тестировании и идентификации происхождения, включая TGLA227, BM2113, TGLA53, ETH10, SPS115, TGLA126, TGLA122, INRA23, ETH3, ETH225, BM1824 и BM1818. Кроме того, в набор входят следующие шесть микросателлитов, которые входят в список локусов, рекомендованных Продовольственной и сельскохозяйственной организацией Объединенных Наций (ФАО) для генетических исследований домашних животных: SPS113, RM067, CSRM60, MGTG4B, CSSM66 и ILSTS006. Панель генотипов крупного рогатого скота 3.1 представляет собой комбинацию панелей 1.2 и 2.2, что позволяет проводить анализ обеих панелей в одной реакции.