Набор для анализа APO‑BrdU TUNEL содержит материалы, необходимые для маркировки разрывов нитей ДНК для обнаружения апоптотических клеток, а также фиксированные образцы положительных и отрицательных контрольных клеток для оценки эффективности анализа. Также включены полные протоколы для приложений проточной цитометрии, хотя набор может быть адаптирован для использования с флуоресцентной микроскопией. Окончательное обнаружение включения BrdU в местах разрыва ДНК достигается с помощью меченого красителем Alexa Fluor 488 антитела к BrdU. В набор также входит иодид пропидия для определения общего содержания клеточной ДНК.

Набор для анализа APO‑BrdU TUNEL обнаруживает фрагментацию ДНК апоптотических клеток, используя тот факт, что разрывы ДНК обнажают большое количество 3´-гидроксильных концов. Эти гидроксильные группы затем могут служить отправными точками для терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы (TdT), которая добавляет дезоксирибонуклеотиды независимо от шаблона. Добавление аналога дезокситимидина 5-бром-2´-дезоксиуридина 5´-трифосфата (BrdUTP) к реакции TdT служит для маркировки мест разрыва. После включения в ДНК BrdU может быть обнаружен антителом к ​​BrdU с использованием стандартных иммуногистохимических методов. Этот метод маркировки разрывов ДНК называется Terminal Deoxynucleotide Transferase dUTP Nick End Labeling или TUNEL.