FGFR4 является членом семейства рецепторных тирозинкиназ FGFR. Известно, что это семейство регулирует множество клеточных функций, включая ангиогенез, митогенез, остеогенез, миогенез, канцерогенез, клеточную дифференцировку и восстановление тканей после травмы. Семейство FGFR также вовлечено в ряд заболеваний, включая рак, ревматоидный артрит и диабетическую ретинопатию. FGFR4 необходим для нормальной понижающей регуляции экспрессии CYP7A1, фермента, ограничивающего скорость синтеза желчных кислот, в ответ на FGF19. FGFR4 играет роль в постнатальном развитии легких и может быть вовлечен в развитие линий клеток скелетных мышц.