Thermo Scientific Canine Genotypes Panel 1.1 — это набор реагентов для тестирования и идентификации происхождения собак с использованием локусов ДНК с короткими тандемными повторами (STR). Благодаря высокому уровню информативности и менделевскому наследованию микросателлиты стали маркерами выбора для тестирования происхождения, идентификации и судебной экспертизы.

Canine Genotypes Panel 1.1 содержит все необходимые реагенты для амплификации 19 микросателлитных локусов. Набор содержит мастер-микс и смесь праймеров, что позволяет проводить совместную амплификацию микросателлитов в одной мультиплексной реакции ПЦР. Контрольная ДНК собак предоставляется для проверки приемлемых условий ПЦР и электрофореза. Реагенты и протоколы набора Canine Genotypes Panel 1.1 были оптимизированы для обеспечения схожих размеров пиков (выходов амплификации) для каждого локуса. Аллельные вызовы, полученные с помощью этого набора, представляют собой истинные аллели индивидуума, а не «пики плюс-А» или «разделенные пики», которые обычно интерпретируются при использовании, например, обычной ДНК-полимеразы Taq . В наборе используется ДНК-полимераза Phusion Hot Start, которая обладает корректирующей активностью и устраняет «пики плюс-А». Один праймер из каждой пары праймеров помечен флуоресцентным красителем на конце. После ПЦР фрагменты разделяются и обнаруживаются в одной инъекции электрофореза с использованием автоматизированного прибора для капиллярного электрофореза.

Canine Genotypes Panel 1.1 охватывает следующие 19 локусов: AHTk211, CXX279, REN169O18, INU055, REN54P11, INRA21, AHT137, REN169D01, AHTh260, AHTk253, INU005, INU030, FH2848, AHT121, FH2054, REN162C04, AHTh171, REN247M23 и Amelogenin (локус, определяющий пол). Эти маркеры включены в «основную панель» локусов, рекомендованных Комитетом прикладной генетики животных Международного общества генетики животных (ISAG).

Основные моменты

• Единая мультиплексная ПЦР 19 STR-локусов
• Для удобства пипетирования предоставляются мастер-микс и праймерная смесь
• Для проверки условий ПЦР и электрофореза предоставляется контрольная ДНК
• Аллельные вызовы представляют собой истинные аллели (без пиков плюс-А)